Nos espermatozóides, as histonas somáticas são substituídas por (ou acrescentadas de) outros tipos de proteínas nucleares básicas. Essas podem ser do tipo caracterizado por uma riqueza especial em arginina, a ponto do polipeptídeo ser considerado quase uma poliarginina, como acontece no salmão. Nesse caso, a proteína é conhecida como protamina ou clupeína, tem uma massa molecular em torno de 4.000 daltons e uma afinidade muito alta por DNA em dupla fita, tornando o complexo DNA-proteína muito estável e de difícil dissociação.

     Em espermatozóides de mamíferos, pode ocorrer uma proteína rica em arginina, classificada como “semelhante à protamina” ou queratinosa, por conter também o aminoácido cisteína. Há ainda espermatozóides em que a proteína nuclear básica é uma variante da H1, muito rica em lisina e com variada presença de regiões α-hélice. Este tipo ocorre em ouriço-do-mar, abelhas e alguns anfíbios. Embora se tenha tentado estabelecer uma correlação entre tipos de proteína básica nuclear presentes em espermatozóides e filogênese, até o momento não se logrou êxito. (Carvalho e Recco-Pimentel, 2007)